Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO1Q9UM00 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms