Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNB3Q9ULL4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1127.4 ms