Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GRID1Q9ULK0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms