Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms