Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDV3Q9UKY7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDV3Q9UKY7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms