Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCTN4Q9UJW0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms