Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF11Q9UIL8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms