Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms