Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCF2Q9UG63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF2Q9UG63 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms