Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF3KQ9UBQ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF3KQ9UBQ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms