Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms