Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPR1Q9UBH6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPR1Q9UBH6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms