Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMC3IPQ9P2W1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC3IPQ9P2W1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC3IPQ9P2W1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms