Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL13Q9P2N7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms