Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDH10Q9P2E7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDH10Q9P2E7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms