Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN3Q9P1Z3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN3Q9P1Z3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms