Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HMG20BQ9P0W2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMG20BQ9P0W2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms