Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBP1Q9NZI7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBP1Q9NZI7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBP1Q9NZI7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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