Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ2Q9NZG7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ2Q9NZG7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms