Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MIS18AQ9NYP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MIS18AQ9NYP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms