Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL39Q9NYK5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL39Q9NYK5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms