Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D2Q9NY47 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D2Q9NY47 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms