Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX43Q9NXZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX43Q9NXZ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms