Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKS1Q9NXB0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms