Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC28Q9NX36 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAJC28Q9NX36 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms