Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1R1Q9NWW0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms