Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT57Q9NWB7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT57Q9NWB7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT57Q9NWB7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms