Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM28Q9NW13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM28Q9NW13 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms