Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INTS9Q9NV88 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms