Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39AQ9NV64 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39AQ9NV64 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms