Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECHDC1Q9NTX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC1Q9NTX5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms