Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4GQ9NTN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms