Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDS5BQ9NTI5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDS5BQ9NTI5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms