Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF275Q9NSD4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms