Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM7SF3Q9NS93 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM7SF3Q9NS93 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms