Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LTBP3Q9NS15 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTBP3Q9NS15 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTBP3Q9NS15 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms