Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGAP35Q9NRY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ARHGAP35Q9NRY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms