Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFCQ9NRA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFCQ9NRA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFCQ9NRA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms