Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSS2Q9NR19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSS2Q9NR19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms