Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC31BQ9NQW1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC31BQ9NQW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms