Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NOP10Q9NPE3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOP10Q9NPE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms