Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPCPD1Q9NPB8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPCPD1Q9NPB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPCPD1Q9NPB8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms