Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms