Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRHQ9HD43 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRHQ9HD43 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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