Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARVBQ9HBI1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARVBQ9HBI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms