Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN28AQ9H9Z2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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