Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NHEJ1Q9H9Q4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms