Protein–RNA interactions for Protein: Q9H867

VCPKMT, Protein-lysine methyltransferase METTL21D, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPKMTQ9H867 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCPKMTQ9H867 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPKMTQ9H867 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCPKMTQ9H867 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms