Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WDR55Q9H6Y2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms