Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RETREG1Q9H6L5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms